Una zanahoria es una raíz. A diferencia de las raíces más fibrosas, que se desarrollan más tarde en el ciclo de vida de la planta, la raíz primaria es la primera raíz que emerge de la semilla germinadora, llamada radícula. Para la mayoría de las plantas, la radícula muere y se reemplaza con un sistema de ramificación y propagación de las raíces.
Las zanahorias pueden variar en forma y tamaño, pero la mayoría de las zanahorias son cónicas. La raíz principal está compuesta por células del floema externo y células del xilema interno. El floema, también conocido como la corteza, es donde los azúcares se transportan desde las hojas hacia las raíces. El xilema, o núcleo, transporta el agua y los minerales desde el suelo hasta las hojas. La mayoría de las zanahorias han sido seleccionadas para tener más corteza que núcleo, de ahí el sabor dulce.