Los cocineros no tienen que quitar las branquias de los hongos Portobello. Los que elijan eliminar las branquias pueden usar una cuchara para rasparlas.
La eliminación de las branquias de los hongos portobello puede ser beneficiosa para la presentación del plato que se está preparando, ya que puede hacer que otros ingredientes se vuelvan negros debido a que las branquias le dan su color a todo lo que alguien hace con ellos. La decoloración del color puede afectar a las salsas, rellenos o aderezos que alguien usa en su receta. Algunas branquias esconden un poco de arena del lugar donde crecieron los hongos, por lo que eliminarlas puede evitar que la arena llegue a los alimentos. Cuando queda arena en las agallas, esto puede hacer que la comida salga áspera porque cocinar los champiñones no la elimina.