No es seguro comer harina cruda. El Boletín de Envenenamiento de Alimentos advierte que la harina cruda puede contener bacterias patógenas, y comerla puede causar enfermedades. Además de evitar el consumo de cualquier harina cruda, es importante tratar la harina cruda igual que otros ingredientes crudos potencialmente peligrosos. Para evitar la contaminación cruzada, los cocineros siempre deben desinfectar las superficies expuestas a la harina cruda y lavarse las manos después de manipular la harina cruda.
El New York Times informa que un brote de E. coli de 2009 se debió al consumo de masa de galleta comercial lista para comer, lista para comer, sin cocer, y que la harina cruda en la masa probablemente fue la causa. p>
Dr. Karen Neil, una epidemióloga médica que trabaja para los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades, explica que la harina cruda fue el único ingrediente agrícola crudo en la masa de galletas cruda envasada. Debido a que no se sometió a ningún proceso para matar patógenos, probablemente provocó la contaminación de la masa para galletas. Los huevos utilizados en la masa se pasteurizaron, lo que mata a los patógenos, y el azúcar, la melaza, la margarina y el bicarbonato de sodio también pasaron por varias etapas de eliminación de patógenos durante el procesamiento.
El New York Times informa que, según un estudio de 2008, el 53 por ciento de los estudiantes universitarios admitió comer masa de galletas sin hornear.