Los mejillones pueden congelarse, sin embargo, si ya están cocidos, la carne extraída debe almacenarse en un recipiente de plástico. La carne debe cubrirse con una solución de 1 taza de agua y 1 cucharadita de sal.
La solución de agua salada se conoce como salmuera, y en lugar de congelar los mejillones cocidos en una solución briney, se pueden cubrir con el jugo que se usó para cocinarlos. Antes de congelar, los mejillones crudos se deben escaldar ligeramente durante 20 segundos en agua hirviendo. Después del escaldado, los mejillones deben drenarse y colocarse en recipientes de plástico o bolsas de congelación. Los mejillones que están congelados en sus conchas se mantienen durante aproximadamente dos meses.