La harina cruda puede ser peligrosa para consumir debido a sus altos niveles de bacterias. La harina generalmente no se somete a un proceso de tratamiento térmico para eliminar los patógenos. Estos patógenos, cuando se comen crudos en productos como la masa cruda de galletas, pueden enfermar a los consumidores.
En 2009, se produjo un brote de E. coli debido a la masa de galletas de Nestle Toll House, como lo señala el archivo de noticias WebMD. Hubo 77 personas en 30 estados afectados por el brote y todos después de comer la masa para galletas Nestle Toll House sin hornearla primero. 35 personas fueron hospitalizadas, lo que provocó el retiro inmediato de 3,6 millones de paquetes de masa para galletas.
Al principio, se creía que el culpable del brote eran los huevos crudos, pero después de un examen más detenido, se dejó que los CDC y la FDA asumieran que el contaminante era harina cruda. En ese momento no pasó por ningún proceso de tratamiento térmico para eliminar patógenos como los otros ingredientes que se encuentran en la masa para galletas. Desde ese incidente, varios fabricantes, incluido Nestlé, comenzaron a implementar un proceso de calentamiento en sus fábricas para reducir las bacterias en la harina con la esperanza de evitar nuevos brotes.
