Prácticamente todos los quesos disponibles para comprar en supermercados y queserías están lo más cerca posible de estar sin gluten, lo que significa que todos contienen un nivel indetectable de gluten. Los ingredientes principales del queso son la leche. cuajo (una enzima que cuaja la leche) y bacterias (que fermentan la leche).
Al practicar una dieta sin gluten, siempre se debe tener cuidado con la contaminación cruzada con gluten, así como cuando se agregan otros ingredientes como condimentos en los quesos. Está surgiendo una nueva tendencia de la cerveza y los quesos empapados en alcohol, como el queso cheddar irlandés con cerveza fuerte o el whisky irlandés. Ambos añaden un nivel peligroso de gluten a los quesos que saborean. En estos casos, se recomienda encarecidamente a quienes padecen alergias al gluten que eviten consumir cualquiera de estos tipos de queso.
Además, las personas que padecen alergias al gluten o la enfermedad celíaca se han preocupado por ciertos tipos de quesos azules que contienen gluten debido a que las bacterias clásicamente utilizadas para elaborarlos, Penicillium roqueforti, se cultivan tradicionalmente en centeno, malta o dextrosa a base de trigo todos los cuales contienen gluten. Un estudio realizado en 2009 por la Canadian Celiac Association probó un grupo de quesos azules para el gluten y encontró que todos los niveles eran menos de una parte por millón, lo cual es un nivel indetectable. Sin embargo, las personas que tienen la enfermedad celíaca siempre deben actuar con precaución, por lo que siempre debe solicitarle al vendedor la mayor información posible sobre los orígenes de un producto que está considerando comprar.
