Una tarta de manzana horneada se puede almacenar sin refrigerar y a temperatura ambiente hasta por dos días. Una vez cortada la tarta, se debe cubrir con papel de aluminio o plástico. Una tarta de manzana sin hornear debe almacenarse en el refrigerador o congelarse.
Para que la tarta de manzana al horno se mantenga por más tiempo, puede almacenarse en el refrigerador por dos o tres días adicionales o congelarse. Si está congelado, el pastel comienza a perder su calidad después de aproximadamente cuatro meses. Una tarta de manzana sin cocer tiene la misma vida útil de congelación que una tarta de manzana al horno. Sin embargo, una tarta de manzana sin hornear congelada debe hornearse sin descongelarse con anticipación, y una tarta de manzana al horno congelada debe colocarse en el refrigerador para descongelar.