Cuando se agrega al agua hirviendo, los ñoquis se cocinan en aproximadamente 2 minutos. Una vez que el gnocchi está flotando sobre el agua hirviendo, está listo para drenar y servir.
Los profesionales de la cocción recomiendan usar entre 4 y 6 cuartos de galón de agua por cada libra de ñoquis que se cocinan. Si el gnocchi está congelado, es mejor no descongelarlo, sino colocarlo directamente en el agua hirviendo del congelador y remover el gnocchi hasta que se separe. La pasta congelada requerirá tiempo de cocción adicional. Los ñoquis cocidos se pueden almacenar hasta tres días en un refrigerador o congelar hasta un mes.