Los brotes de soja se pueden congelar siempre que se almacenen correctamente. Un aspecto principal de su atractivo cuando se usan en alimentos es su textura, específicamente su contracción. Para que los brotes de soja conserven su contracción, deben estar libres de quemaduras por congelación.
La prevención de quemaduras por congelación significa que los brotes, a pesar de las instrucciones habituales para mantener los brotes frescos crujientes agregando agua, deben estar lo más secos posible antes de congelarlos. La quemadura del congelador es causada por la humedad presente en los productos alimenticios cuando están congelados. También es muy importante que los brotes de frijol se almacenen correctamente porque pueden ser una fuente de enfermedades transmitidas por los alimentos si se contaminan con bacterias.
