Panera Bread cambia su menú de almuerzo al ofrecer opciones diarias de sopa, y la cadena de restaurantes también ofrece opciones de menú nuevas y recurrentes cada primavera, verano, otoño e invierno. Cada día, Panera ofrece siete sopas con dos en un horario rotativo.
Todos los domingos, martes, jueves y sábados, las opciones de sopa alternas son Sopa de frijoles negros vegetarianos bajos en grasa y Sopa de crema de pollo y arroz salvaje, a partir de 2015. Todos los lunes y miércoles, son Sopa de papa horneada Sopa Vegetal Gorda Vegetariana Con Pesto. Todos los viernes, se agregan al menú la sopa de verduras vegetariana baja en grasa con pesto y la sopa de almejas New England.
Los menús de temporada ofrecen elementos como la semilla de amapola de fresa y la ensalada de pollo en la primavera y el verano, los raviolis de calabaza en el otoño y la harina de avena con quinua y almendra durante el invierno.
