El comandante del ejército confederado era el general Robert E. Lee. El presidente Lincoln le ofreció originalmente a Lee el Ejército de la Unión, pero rechazó la oferta porque no quería luchar contra sus compatriotas virginianos.
El general Robert E. Lee fue un oficial militar de por vida. Asistió a la Academia Militar de los Estados Unidos en West Point y se graduó segundo en su clase. Después de rechazar la oferta del presidente Lincoln de dirigir el Ejército de la Unión, Lee se unió al Ejército Confederado recién formado cuando Virginia se separó de los Estados Unidos. Intentó invadir el Norte varias veces, pero finalmente fracasó. En 1865, Lee se rindió al General Ulysses S. Grant en el Palacio de Justicia de Appomattox para poner fin a la Guerra Civil.
