No se han presentado pruebas que indiquen que la carbonatación en el agua carbonatada sea perjudicial para las personas. El consumo de colas carbonatadas se ha relacionado con una baja densidad mineral ósea y el contenido de azúcar en los refrescos carbonatados desempeña un papel la caries dental.
Algunos estudios han indicado que el agua carbonatada ayuda a la digestión y alivia la indigestión y el estreñimiento. Las inquietudes de que el agua carbonatada filtra el calcio de los dientes, causa cálculos renales o dañan el esmalte dental no están demostradas por estudios clínicos. Si bien el agua carbonatada es un poco más ácida que el agua, no hay evidencia de que el agua carbonatada sin sabor dañe el esmalte dental. El único inconveniente de beber agua carbonatada es que puede hacer que las personas eructen y expulsen gases, especialmente si se consume demasiado rápido.