La principal diferencia entre las células procarióticas y las eucariotas es que las células eucarióticas tienen un núcleo y orgánulos unidos a la membrana, mientras que las células procarióticas carecen de estas estructuras. Las células procariotas son las más simples de todas las cosas vivas Solo existen como bacterias unicelulares. Todos los organismos multicelulares y las bacterias de orden superior están formadas por células eucarióticas.
Los procariotas y los eucariotas también difieren en términos de tamaño de celda. De acuerdo con la Universidad de Maryland, las células procariotas suelen tener un diámetro de aproximadamente 0,2 a 2,0 micrómetros, mientras que las células eucariotas tienen entre 10 y 100 micrómetros de diámetro. Aunque ambos tipos de células pueden tener flagelos, la estructura de estos flagelos es diferente. Los de las células procarióticas consisten en dos bloques de construcción de proteínas, mientras que los de las células eucarióticas se componen de complejos arreglos de microtúbulos.
Si bien las células procariotas no contienen orgánulos unidos a la membrana, sí contienen ribosomas. Sin embargo, estos son más pequeños que los ribosomas que se encuentran en las células eucariotas. El ADN de las células procarióticas también es circular en lugar de lineal, como lo es en los eucariotas. Los dos tipos de células también se dividen de diferentes maneras: las células procarióticas por fisión binaria y las células eucariotas por mitosis. La reproducción sexual en procariotas implica solo la transferencia de fragmentos de ADN entre dos células, mientras que la reproducción sexual en células eucariotas se produce por el proceso de meiosis.