Los planes del presidente Andrew Johnson para la reconstrucción eran los mismos que los planes del presidente Lincoln: el sindicato se reuniría y el sur no debería ser castigado. Johnson planeó hacer esto perdonando a los sureños que, aunque Tomó parte en la guerra, prometió lealtad a los Estados Unidos. También volvió a ingresar a los estados en la unión si el 10 por ciento de los votantes blancos del estado prometían lealtad. Después de volver a unirse al sindicato, él les permitió reformar su gobierno sin esclavitud.
A pesar de estos grandes avances en la Reconstrucción, Johnson no fue apoyado o popular con el poderoso Partido Republicano. El partido republicano quería más énfasis en proteger a los esclavos liberados y hacer más difícil el reingreso a la unión. Además, a los republicanos les preocupaba la rapidez con que los estados del sur aprobaban leyes para limitar las libertades de los antiguos esclavos. Andrew Jackson y el Congreso no trabajaron bien juntos. Rechazaron sus planes para la Reconstrucción, y Jackson a cambio vetó sus planes. Sin embargo, el Congreso pudo votar sus planes de reconstrucción con un margen suficientemente grande. El Congreso también limitó el poder presidencial de Jackson a través de la aprobación de la Ley de Tenencia de la Oficina. Esto significaba que Jackson ya no podía destituir a los funcionarios federales. Cuando Jackson lo hizo de todos modos con el Secretario de Guerra Edwin Stanton, el Congreso trató de impugnarlo. La Cámara votó para hacerlo, pero la votación se quedó corta en el Senado. Esta disputa terminó en 1869 cuando Ulysses S. Grant se convirtió en presidente y apoyó totalmente los planes de reconstrucción del Congreso.
