Según los investigadores de la Biblioteca del Congreso, el manejo exitoso de la Rebelión de Whisky impuso varias ideas constitucionales que impugnó la rebelión, como el derecho del gobierno federal a aprobar y hacer cumplir las leyes, y el derecho de cobrar impuestos a los ciudadanos de todos estados El uso de la fuerza terminó con la Rebelión de Whisky en 1794.
En 1791 el gobierno federal estaba endeudado, habiendo asumido toda la deuda de la Guerra Revolucionaria para los estados. Para ayudar a pagar esta deuda, el Congreso aprobó un impuesto especial sobre los aguardientes destilados. El impuesto se evaluó en función de la capacidad del alambique. Varió de seis a 18 centavos por galón y tuvo que pagarse en efectivo. Este fue el primer impuesto a las ganancias internas a nivel nacional, según la Oficina de Impuestos y Comercio de Alcohol y Tabaco de los Estados Unidos.
Al oeste de las montañas de los Apalaches y Allegheny, el whisky se usaba a menudo como moneda. Muchos agricultores convirtieron sus cultivos en whisky porque era más fácil de transportar que el grano y también tenía un mejor valor de mercado. En parte debido a la larga inquietud sobre los ataques de los indios, los agricultores se opusieron al impuesto. Muchos simplemente se negaron a pagar, y los recaudadores de impuestos fueron acosados a menudo; algunos incluso estaban alquitranados y con plumas.
La violencia se intensificó hasta que el presidente Washington marchó con milicias reunidas de los estados para sofocar la rebelión. A mediados de noviembre de 1794, 150 rebeldes habían sido arrestados. La mayoría fueron liberados sin pruebas, algunos fueron juzgados y solo dos fueron condenados por traición, los cuales fueron posteriormente indultados por el presidente Washington. Una parte de la milicia permaneció hasta la primavera siguiente, momento en el que la rebelión había sido eliminada con éxito.