Como las amebas son microscópicas, solo pueden ingerir otras partículas microscópicas de alimentos, como algas, bacterias, materia vegetal o animal en descomposición y otros organismos de células individuales. Las grandes partículas de alimentos serían imposibles para las amebas digerir. La ameba se alimenta al engancharse al elemento adecuado y luego rodea y envuelve la comida dentro del cuerpo de la ameba.
Para agarrar la partícula de alimento, la ameba usa una parte del cuerpo conocida como seudópodo, que puede extenderse desde la parte principal de su cuerpo. El pseudópodo es probablemente la parte más importante de la célula de la ameba, ya que el organismo también se mueve al estirar esta parte del cuerpo para empujarse. La otra parte primaria de la célula es el citoplasma, una sustancia líquida gelatinosa que llena la célula.
Cuando la ameba empuja la comida hacia su cuerpo, el citoplasma dentro de la célula rodea la partícula de comida y la almacena con una gota de agua en la vacuola de la comida. El citoplasma secreta enzimas digestivas en la vacuola de los alimentos que destruyen las partes más blandas de la presa. Una vez que esto sucede, los nutrientes solubles se absorben en el citoplasma. A medida que la ameba avanza, el citoplasma libera cualquier parte que no haya sido disuelta.