La temperatura afecta el porcentaje de semillas que germinan y la tasa de germinación. Las semillas mantenidas a temperaturas más altas tienen más probabilidades de deteriorarse y no germinar. Una vez que las semillas comienzan a germinar, las temperaturas más altas estimulan una germinación más rápida hasta una temperatura óptima, después de lo cual la velocidad de germinación disminuye.
La temperatura óptima para la velocidad de germinación varía según la especie. Las semillas secas tienen más probabilidades de germinar a temperaturas más altas, pero las semillas húmedas tienen menos probabilidades de germinar a temperaturas más altas. Es probable que la alternancia entre temperaturas frías y altas estimule la germinación de muchas semillas húmedas. Algunas especies de semillas son estimuladas para germinar por temperaturas muy frías.