Los cinco grupos principales de organismos unicelulares son protozoos, arqueas, bacterias, hongos unicelulares y algas unicelulares. Mientras que los organismos unicelulares pueden ser eucariotas o procariotas, la mayoría son procariotas. Los dos dominios en los que se dividen las células procariotas son arqueas y bacterias.
Aunque los protozoos son organismos unicelulares, se clasifican biológicamente como eucariotas. Los eucariotas son organismos con células que tienen núcleos. A pesar de su simplicidad, los protozoos tienen similitudes con los animales, como la movilidad. Las algas y hongos unicelulares, que pueden ser bastante grandes a pesar de tener una anatomía simple, también son eucariotas.
Hasta finales de la década de 1970, Microbe World afirma que los científicos pensaban que las arqueas eran un tipo de bacteria. Sin embargo, aunque se parecen y comparten muchas similitudes, la composición genética de estos dos microorganismos es diferente. Tanto las arqueas como las bacterias son ejemplos de organismos procarióticos unicelulares. Archaea y las bacterias son dos de los tres dominios principales que la mayoría de los biólogos utilizan para agrupar organismos vivos.
Se ha descubierto que las arqueas prosperan en condiciones extremas, como las aguas termales y los respiraderos calientes bajo el agua, así como en ambientes altamente ácidos. Las bacterias también se pueden encontrar en ambientes extremos, así como en casi cualquier otro lugar, lo que los convierte en uno de los grupos más diversos del planeta.
