Los omnívoros que viven en arrecifes de coral incluyen peces, cangrejos y otros crustáceos. Los peces coralinos se alimentan de algas y animales, mientras que los cangrejos consumen algas, bacterias, hongos, moluscos y gusanos. La dieta de los cangrejos también incluye detritos y otros crustáceos.
Los animales llamados pólipos de coral dominan los ecosistemas de arrecifes de coral y constituyen la base estructural de los arrecifes de coral. Los vertebrados, o animales que tienen espinas dorsales, e invertebrados, o animales que carecen de espinas dorsales, son los dos grupos primarios de animales que viven en arrecifes de coral.
Los crustáceos de arrecife de coral más grandes incluyen cangrejos, langostas y camarones, mientras que los más pequeños incluyen copépodos, estomatópodos y anfípodos. Los crustáceos se caracterizan por un esqueleto articulado exterior y apéndices pareados que les permiten moverse y alimentarse de la presa. Algunos crustáceos son omnívoros, pero otros son depredadores activos o carroñeros.
Los cangrejos que viven en arrecifes generalmente permanecen dentro de la estructura del arrecife durante el día. Algunos cangrejos de arrecife contribuyen a la salud de los arrecifes de coral al limpiar las colonias de corales duros. Se deshacen de los organismos dañinos, como los parásitos infestados, de los cuerpos de los hospedadores.
Los peces de arrecifes de coral se alimentan de varios crustáceos. Alrededor de 1.000 especies de gobios devoran pequeños animales que viven en el fondo, incluyendo camarones y gusanos. Las damiselas consumen zooplancton suspendido sobre los corales. Los peces loro y pez cirujano pican las algas en los arrecifes, limpiando así las superficies y permitiendo que varios animales colonizadores vivan en los arrecifes.