Las enzimas proteasas descomponen las proteínas en péptidos, mientras que las enzimas peptidasas descomponen trozos más pequeños de proteínas en aminoácidos. Las glándulas gástricas secretan pepsinógeno en el estómago, que es un ambiente altamente ácido después de una la persona come
La acidez hace que el pepsinógeno se active, descomponiendo las proteínas como la enzima pepsina. Otras enzimas como la quimotripsina, la tripsina y la carboxipedidasa también ayudan en la digestión de las proteínas. Las proteasas y las petidasas también se usan en algunos detergentes para descomponer las manchas orgánicas. Los inhibidores de la proteasa se usan para ayudar a los pacientes con el virus del SIDA, porque el virus usa proteasas mientras se reproduce.