Las pruebas bioquímicas se usan para detectar la presencia o ausencia de bacterias gramnegativas o grampositivas. Estas pruebas se usan comúnmente en los campos de la ciencia y la medicina, particularmente en biología. Las pruebas bioquímicas se realizan utilizando una variedad de métodos y técnicas experimentales; el método de prueba varía según si los investigadores están probando bacterias positivas o negativas.
La prueba de agar de sal de manitol (MSA, por sus siglas en inglés) es ampliamente utilizada por biólogos y químicos para evaluar la presencia de bacterias grampositivas, como las especies Staph y Strep. Esta prueba se clasifica como selectiva y diferencial: el principal ingrediente diferencial en la MSA es el azúcar manitol; esta sustancia se utiliza para atraer organismos (bacterias grampositivas) que se alimentan de manitol como fuente de alimento. Al consumir la sustancia, estas bacterias producen subproductos ácidos, también llamados fermentación, que en última instancia disminuyen el pH de los medios circundantes. Los diversos grados de acidez producidos por los medios se utilizan como indicadores de pH, que varían en color de rojo a naranja y amarillo pálido. Según la Universidad de Wyoming, las pruebas de oxidasa se usan para determinar la presencia de bacterias gramnegativas, específicamente las bacterias que contienen la enzima oxidasa. En esta prueba, los resultados positivos se producen cuando los electrones son oxidados por la citocromo oxidasa, que se vuelve de color púrpura oscuro.