El agua del inodoro contiene cantidades significativas de bacterias. Uno de los más comunes, C. difficile, causa cantidades significativas de diarrea y vómitos y vomita tan alto como un pie por encima del asiento del inodoro cuando las personas se vacían mientras La tapa está abierta, según Prevención.
El inodoro no tiene que estar en uso para que las bacterias estén presentes. Científicos de la Universidad de Leeds encontraron bacterias en la parte superior y en los costados del inodoro y el piso, incluso cuando nadie se había lavado en un rato. Los niveles de bacterias están en su nivel más alto directamente después del lavado, pero las gotas contaminadas aparecen en las superficies cercanas, incluso una hora después de la última descarga. Mantener la tapa cerrada es una excelente manera de controlar la propagación de esta bacteria.