Según la Sociedad Americana de Microbiología, los antisépticos funcionan cambiando el pH del ambiente de las bacterias, haciendo que el ambiente sea habitable. Dado que los microorganismos se adaptan a sus entornos, los antisépticos tienen que trabajar rápidamente para eliminarlos. la bacteria antes de que tenga la oportunidad de adaptarse.
El cuerpo es capaz de combatir naturalmente la mayoría de los tipos de bacterias. De hecho, es la exposición a las bacterias lo que ayuda al cuerpo a desarrollar una resistencia. Los estudios indican que el uso de antibióticos, antisépticos y otros productos para matar los gérmenes en los niños contribuye en gran medida al desarrollo de alergias en el futuro.
Según los Centros de Control y Prevención de Enfermedades, una de las mayores preocupaciones en el campo médico es un grupo de microorganismos que desarrollan una resistencia a los antisépticos y antibióticos. Debido a la rápida tasa de mutación y los tiempos de proliferación, existe la preocupación de que una pequeña colonia de bacterias resistentes a los antisépticos y antibióticos tenga el potencial de convertirse rápidamente en una gran colonia. Bacterias como esta pueden dar lugar a una nueva forma de patógeno que posee una resistencia natural a la medicina moderna. Esto funciona de la misma manera que una persona que solo toma la mitad de sus antibióticos, dando lugar a lo que los científicos y los médicos denominan supergacterias, que se han vuelto resistentes a los antibióticos.