Los peces tienen un sistema digestivo básico con estómagos que se adaptan al tipo de alimento que comen los peces. Los alimentos que se ingieren se digieren parcialmente en el estómago antes de pasar al intestino donde se digieren más, y en el estómago se absorben los nutrientes de los alimentos ingeridos.
El alimento que no se absorbe sale del cuerpo del pez a través de la abertura anal como residuo. Es importante alimentar a los peces con los alimentos que se recomiendan para ellos. Por ejemplo, los peces herbívoros requieren una dieta alta en fibra, mientras que los peces carnívoros necesitan alimentos ricos en proteínas. Los carnívoros tienen intestinos más cortos y, en general, sistemas más simplistas, por lo que el proceso de mover los alimentos a través del cuerpo difiere ligeramente.