Los ecosistemas marinos y de agua dulce interactúan en ecosistemas costeros donde los dos ambientes se entremezclan en manglares, estuarios y bahías entre otros ambientes. La mezcla de agua dulce y salada da lugar a esferas ecológicas y biodiversidad únicas que no pueden sobreviven en cualquier condición que no sean las que proporcionan los ecosistemas costeros.
Los manglares se producen donde se mezclan el agua salada y el agua dulce, lo que permite el crecimiento de árboles de mangle imponentes que luego forman canales y estanques debido al crecimiento de sus sistemas de raíces. Estos ambientes únicos como pantanos albergan crustáceos, peces y muchos otros tipos de animales que prosperan en el intersticio entre los ecosistemas.
Algunos animales pueden moverse libremente entre el agua dulce y el agua salada. Estos animales incluyen el cocodrilo de agua salada y varias especies de peces. Así adaptados, pueden cruzar dentro y fuera de los ecosistemas costeros sin tener que preocuparse por el daño a sus órganos debido a la incapacidad de procesar uno de los entornos dados.
Los ecosistemas costeros son muy sensibles a la actividad humana y, debido a su escala limitada y altas tasas de diversidad especializada, pueden ser gravemente dañados por la contaminación y la navegación. Muchos ecosistemas costeros están en riesgo debido al transporte marítimo y otras actividades humanas dentro o alrededor de sus fronteras, lo que hace que estos ecosistemas sean de los más frágiles del mundo.
