Las ballenas juegan un papel importante dentro del ecosistema marino, y si desaparecieran, el delicado equilibrio de la naturaleza se vería afectado. Según Scitable, cada vez que una ballena muere, deja un cadáver que proporciona alimentos y nutrición vital para literalmente cientos de organismos de la vida marina. Por ejemplo, especies de crustáceos y gusanos carroñeros se dan un festín con las canales de ballenas para su sustento.
Otras especies de peces, incluidos los tiburones, también obtienen alimentos de una canal de ballena. Sin esta abundante fuente de alimentos, ciertas partes del océano dejarían de prosperar.
Las ballenas vivas también contribuyen en gran medida al ecosistema marino en forma de heces de ballena. De acuerdo con Columbia Basin Fish and Wildlife News, un estudio encontró que las heces de las ballenas están llenas de ricos nutrientes que incluyen nitrógeno, que estimula el crecimiento de las plantas. Los organismos, como el plancton, que alimentan la cadena alimenticia del océano también se benefician de toneladas de heces de ballena que flotan en la superficie del océano. Es probable que la desaparición de esta fuente de nitrógeno natural tenga un efecto negativo en la producción de plantas y alimentos.
Una superpoblación de lobos marinos sería rápidamente evidente tan pronto como las ballenas que se alimentan de ellos desaparecieran. Del mismo modo, las economías de Canadá y los Estados Unidos sufrirían de una falta de dólares turísticos porque la observación de ballenas es muy popular.