Las vacuolas varían en función de los organismos e incluso dentro de la misma célula, pero el uso más frecuente es el almacenamiento de agua o nutrientes. Una vacuola es en realidad un orgánulo de membrana vacía de uso general que es Llena con todo lo que la célula necesita para mantenerse separado del resto del citoplasma. Como tal, diferentes vacuolas también almacenan desechos o incluso toxinas, y algunos organismos tienen otros usos para ellos.
De acuerdo con la City University de Nueva York, las células vegetales dependen particularmente de sus vacuolas, específicamente una gran vacuola central. Esta gran vacuola, que a menudo ocupa una gran mayoría del volumen de la célula, se llena principalmente con agua, pero también con desechos y otras sustancias. Lo notable de esta vacuola es su papel estructural, sin embargo. Las células vegetales carecen del citoesqueleto basado en proteínas que ayuda a las células animales a mantener su forma. En su lugar, utilizan la presión de sus vacuolas centrales infladas contra sus resistentes paredes celulares para mantener su forma, de manera análoga a un globo Mylar.
Dado que la vacuola es en realidad un término general para un orgánulo hueco unido a membrana, el nombre también se aplica a los orgánulos bastante diferentes conocidos como vacuolas contráctiles. Estos se encuentran en muchos organismos unicelulares y ayudan a mantener el equilibrio del agua bombeando físicamente el exceso de agua desde el interior de la célula.