Un anaerobio aerotolerante es un organismo que tolera la presencia de oxígeno, pero no lo necesita para crecer . En cambio, los anaerobios aerotolerantes utilizan la fermentación para sobrevivir. Un organismo de ejemplo es el lactobacilo, una bacteria que vive en el intestino de los seres humanos y también se utiliza en la producción de yogur.
El proceso de fermentación consiste en convertir el azúcar en ácidos, azúcar y /o etanol, como una forma de formar energía. Hay muchas vías de fermentación que se utilizan, más comúnmente a través del ácido láctico. Hongos como las levaduras tienden a usar la fermentación de etanol. Este proceso libera menos energía que los métodos aeróbicos, ya que se basa en la regeneración de ATP a partir de ADP.