La secuencia Shine-Dalgarno es una disposición específica y rica en purinas de nucleótidos en el ARNm procariótico que dirige el ARN a una pequeña subunidad ribosomal para su traducción. Esta secuencia es necesaria para que la unión a los ribosomas y la síntesis de proteínas se produzcan en células procariotas. También se conoce como el sitio de unión al ribosoma.
La secuencia de Shine-Dalgarno se ubica en sentido ascendente desde donde tiene lugar la traducción del mRNA en proteínas, en la región no traducida 5 ', o UTR 5'. Existen múltiples disposiciones de nucleótidos que pueden dirigir el ARNm procariótico a los ribosomas para que se produzca la traducción, y los científicos han descrito múltiples secuencias de Shine-Dalgarno. Típicamente, la secuencia se ve aproximadamente de ocho a 10 codones corriente arriba del codón de inicio AUG que señala el comienzo de la traducción del ARNm procariótico. A pesar de que existen múltiples secuencias Shine-Dalgarno, todas comparten una secuencia de consenso de seis nucleótidos en un orden específico: AGGAGG.
La introducción de mutaciones en la secuencia Shine-Dalgarno puede tener diferentes efectos según el tipo de mutación y su ubicación. Una mutación en la secuencia puede aumentar la tasa de traducción, disminuir la tasa o no tener impacto.
La secuencia Shine-Dalgarno fue descrita por primera vez por los científicos australianos John Shine y Lynn Dalgarno. La secuencia también se ha visto en archaea.
