El ciclo de nitrógeno de un acuario es el proceso por el cual un nuevo acuario se somete a establecer colonias bacterianas, de acuerdo con About.com. A medida que los peces excretan desechos y plantas dentro del acuario, las bacterias crecen para convertir estos desechos en Subproductos menos tóxicos. Los peces están en riesgo hasta que haya suficientes bacterias.
En el estado inicial del ciclo del nitrógeno, los productos de desecho de los peces se descomponen en amoníaco, que puede ser tóxico si se deja por tres días o más. En la siguiente etapa, las bacterias oxidan y eliminan el amoníaco, pero producen nitrito como subproducto, que también es tóxico para los peces. En el estado final, diferentes bacterias convierten los nitritos en nitratos, que no son tóxicos en niveles bajos. Cambiar el agua rutinariamente ayuda a controlar los niveles de nitrato.