Los dos grupos funcionales que se encuentran siempre en los aminoácidos son los grupos carboxilo y amino. Ambos grupos son ácidos. Un enlace peptídico se produce cuando el grupo carboxilo de un aminoácido se une al extremo amino de otro.
Un grupo carboxilo consiste en un átomo de carbono, dos átomos de oxígeno y un átomo de hidrógeno. El grupo amino consiste en un átomo de nitrógeno y dos átomos de hidrógeno. Los grupos carboxilo y amino se encuentran en los extremos opuestos de un aminoácido.
Dos aminoácidos forman un enlace péptido, o amida, cuando se unen. Los extremos amino y carboxilo de los dos aminoácidos se juntan, y el nitrógeno del grupo amino se une con el carbono en el grupo carboxilo. Los hidrógenos en el grupo amino y un oxígeno en el grupo carboxilo se combinan para formar una molécula de agua.
