Aunque las diversas teorías sobre la causa del 9/11 varían ampliamente e incluyen la tesis de los teóricos de la conspiración de que fue un trabajo interno del gobierno de los Estados Unidos, la mayoría de la gente cree que estaba destinado a protestar contra el apoyo de los EE. UU. Israel, así como su presencia militar en Oriente Medio en general. supuestamente, los atacantes eran terroristas islámicos de varias naciones del Medio Oriente financiadas por Osama bin Laden. Cada uno de los 19 secuestradores que tomaron el control de cuatro aviones comerciales con intención de suicidarse se asociaron directamente con el grupo terrorista Al Qaeda de Bin Laden.
Bin Laden declaró una guerra santa contra los Estados Unidos en 1998. En ese momento, pidió el asesinato de civiles estadounidenses en una fatwa que firmó. Varios estudiosos de Medio Oriente creen que el 911 fue la forma de bin Laden de provocar a los Estados Unidos en una guerra que incitaría a los musulmanes de todo el mundo a unirse en oposición a Occidente.
Los críticos del gobierno federal sostienen que el hecho de no frustrar el 11-S fue el resultado de que el gobierno de los Estados Unidos no compartió información entre sus diversas agencias de inteligencia, varias de las cuales habían advertido sobre partes del plan del 11-S. p>
Otros culpan a la seguridad laxa del aeropuerto, señalando el hecho de que los terroristas introdujeron con éxito los cuchillos y los cortadores de cajas en aviones en tres aeropuertos en la costa este.