El bacilo a menudo muestra resistencia a ambientes hostiles como el calor, la radiación, los desinfectantes y el secado debido a sus endosporas. Según MicrobiologyBytes, las esporas de Bacillus tienen una cubierta externa resistente hecha de queratina, lo que las hace altamente resistentes al calor y los productos químicos.
Según el Departamento de Microbiología de la Universidad de Cornell, las endosporas de Bacillus le dan al organismo la capacidad de prosperar y crecer en entornos difíciles como desiertos, aguas termales, suelos árticos y sedimentos marinos. Las endosporas son una forma inactiva de la bacteria y solo unos pocos géneros de bacterias, como Bacillus y Clostridium, son capaces de formar endosporas. Bacillus se encuentra en el suelo, mientras que Clostridium se puede encontrar en el tracto gastrointestinal de los animales.
Las endosporas se forman en condiciones de inanición. Cornell explica que una sola endospora se forma dentro de una bacteria mediante un proceso llamado esporulación, que requiere una gran cantidad de tiempo y energía de la bacteria. Una vez formadas, las capas múltiples de capas resistentes, como la corteza, la capa de esporas y, en ocasiones, el exoesporio, cubren la endospora completa. Hasta que una variedad de desencadenantes ambientales estimulan la germinación, la endospora sobrevive y espera su momento. Una vez que se estimula el crecimiento, se produce un crecimiento de una sola bacteria a partir de la germinación. Las endosporas de Bacillus son una adaptación altamente efectiva en la supervivencia.