Según el Diccionario Merriam-Webster, "no patógeno" significa que un organismo no causa enfermedades, por lo que las bacterias no patógenas no causan enfermedades. Algunas bacterias son útiles en su entorno.
Por ejemplo, el tracto digestivo humano contiene bacterias que lo ayudan a funcionar correctamente. Estas bacterias no solo ayudan en el proceso digestivo, también matan bacterias patógenas. Las bacterias se utilizan en la producción de ciertos productos lácteos, como el queso, la crema agria y el yogur. En el mundo natural, algunas bacterias funcionan como descomponedores, destruyendo organismos muertos. Otros tipos de bacterias consumen aceite, y esta tendencia natural es más visible durante derrames o fugas de aceite.