El moho del pan se reproduce asexualmente, utilizando la mitosis para formar esporas y sexualmente. La reproducción sexual implica el contacto entre cepas de apareamiento opuestas del hongo para formar una zygospore.
El moho del pan, Rhizopus stolonifer, a menudo se reproduce asexualmente. La reproducción comienza poco después de que el moho del pan encuentre un sustrato adecuado y envíe sus estructuras de alimentación, o hifas, para absorber los nutrientes. Los hongos nutridos forman estructuras verticales que contienen las esporas de hongos. Estas esporas son el producto de la mitosis y permanecen con el hongo hasta que las condiciones sean apropiadas para su liberación; Por lo general, las esporas se liberan cuando el clima es cálido y seco. Las nuevas esporas ahora aterrizan en un nuevo sustrato y el ciclo de vida de los hongos continúa.
El moho del pan no tiene sexos opuestos como los animales y algunas plantas, pero tiene dos cepas de apareamiento. Cuando las cepas opuestas crecen una cerca de la otra, las hormonas especiales hacen que se toquen. Cuando se tocan, los citoplasmas de sus células se combinan, y sus núcleos se unen y se unen. La unión de los núcleos provoca la formación de una ciospora. Esta estructura tiene una pared celular muy gruesa y la capacidad de permanecer latente; estas características permiten que una zygospore sobreviva en condiciones difíciles. Cuando las condiciones son favorables, la meiosis se produce dentro de la zygospore para crear esporas para la liberación por el hongo.