El cloro puede matar microorganismos benéficos en el suelo, lo que afecta el crecimiento de las plantas; sin embargo, la mayoría del agua potable clorada no está lo suficientemente concentrada como para afectar negativamente a la vida de las plantas en un área determinada. Esto se debe al hecho de que la tasa de reproducción de microorganismos en el suelo es tan alta que tienden a reproducirse nuevamente antes de que se produzcan. La planta puede ser afectada negativamente por el suelo.
La mayoría de las comunidades agregan pequeñas cantidades de cloro al agua potable para garantizar la seguridad de los residentes. El agua potable típica no contiene cantidades suficientemente altas de cloro para eliminar verdaderamente los microorganismos beneficiosos en el suelo, lo que afecta de manera mínima al crecimiento de las plantas. Los microorganismos beneficiosos que se encuentran en el suelo se reproducen a tasas tan altas, lo que hace que los efectos del agua clorada sean casi irrelevantes.
El cloro también se une a las superficies de las partículas del suelo, lo que reduce la capacidad del cloro para destruir los microorganismos benéficos. Además, a medida que el agua clorada se filtra hacia niveles más bajos de suelo, el cloro se une a las superficies de esas partículas del suelo, lo que significa que el agua contiene menos cloro a medida que se mueve hacia abajo. Los estudios muestran que el suelo sometido a agua potable clorada solo mostró una reducción de microorganismos en la parte superior de 1/2 pulgada de suelo. Los microorganismos en los niveles del suelo a más de 1 pulgada no se vieron afectados por el cloro.
