Algunos ejemplos de un efecto de cuello de botella son el bisonte americano a fines del siglo XIX, el elefante marino del norte en la década de 1890 y el pollo de la pradera mayor durante los siglos 19 y 20 el desastre reduce la población a un pequeño número y, a su vez, su composición genética sufre.
Cuando el tamaño de cualquier población dada se vuelve muy pequeño rápidamente, esto se conoce como un efecto de cuello de botella. Debido a que el tamaño se reduce tan rápidamente, la variación genética también disminuye. La catástrofe de Toba es un ejemplo de un efecto de cuello de botella humano que ocurrió hace unos 70,000 años. Esta fue una erupción supervolcánica que resultó en un invierno volcánico global que duró entre 6 y 10 años, y un episodio de enfriamiento que posiblemente duró 1,000 años después de eso.
Un tipo de efecto de cuello de botella se llama efecto fundador. El efecto fundador es un evento instantáneo, y ocurre cuando un pequeño grupo de individuos deja la población más grande. En esencia, este grupo está comenzando su propia población, pero, debido al pequeño tamaño del grupo de ruptura, no es probable que su composición genética sea similar a la del grupo más grande. Algunos ejemplos del efecto fundador son las comunidades Amish y la gente azul de Kentucky.
