El propósito de la PCR es amplificar pequeñas cantidades de una secuencia de ADN de interés para poder analizarla por separado. la PCR se puede utilizar para crear una gran cantidad de una pieza específica de ADN o para realizar pruebas una muestra de ADN para esa secuencia.
La PCR se utiliza para la investigación cuando es necesario crear una gran cantidad de un solo gen, como la ingeniería genética o la clonación. La PCR también se usa para probar si un producto genético particular está presente o no en una muestra. En medicina forense, la tecnología de PCR se utiliza para llevar a cabo huellas dactilares de ADN para analizar la evidencia de ADN en la escena del crimen. La PCR también se puede utilizar en entornos médicos para llevar a cabo la tipificación de tejidos para trasplantes de órganos.