La mayor parte del ATP para la respiración aeróbica se produce durante el ciclo de Krebs, también llamado ciclo del ácido cítrico, que descompone el piruvato, el producto final de la glucólisis, para producir ATP. Este proceso se duplica. dos veces para que pueda producir el doble de ATP que los ciclos que vienen antes.
La glucólisis produce entre seis y ocho ATP en el primer ciclo, que también produce el piruvato, que se convierte en Acetil COA. Estos COA se procesan para producir otros seis ATP antes de que los restos del COA se procesen en el ciclo del ácido cítrico. El ciclo produce seis NADH, dos FADH2 y dos ATP. El NADH produce 18 ATP por su cuenta, luego el FADH2 produce otros cuatro para ir con los otros dos ATP producidos en este ciclo.