Los organismos unicelulares comen utilizando un proceso llamado fagocitosis. Este proceso permite que el organismo unicelular lleve comida a la parte interna de la célula para la digestión.
Una combinación de sustancias químicas en la superficie del organismo unicelular y en el alimento deseado permite que el organismo reconozca los alimentos y se adhiera a la sustancia que está tratando de comer. Una vez adherido, el organismo envuelve su capa externa, que se llama membrana celular externa, completamente alrededor de la partícula de alimento. Una vez que el alimento ha sido engullido por la membrana celular externa, la membrana se pellizca hacia el interior de la célula, creando un saco dentro de la célula que contiene el alimento llamado vacuola. La vacuola y la comida juntas se llaman fagosoma.
El fagosoma entra en contacto con un lisosoma. Un lisosoma es una vacuola que contiene enzimas. El lisosoma luego inyecta estas enzimas en el fagosoma, y una vez que están dentro, las enzimas descomponen los alimentos en moléculas individuales. Cuando solo quedan organismos individuales de la comida, se considera que ha sido digerido o comido. Estas moléculas se pueden usar para alimentar y construir cualquier cosa que el organismo unicelular necesite.