Según Forensic Fluids Laboratories, las pruebas de drogas con hisopo oral son hasta un 60 por ciento más sensibles a la cocaína, los opiáceos y las metanfetaminas que las pruebas instantáneas basadas en la orina. Esto reduce drásticamente el número de resultados falsos negativos. Forensic Fluids Laboratories cita un estudio del Journal of Analytical Toxicology, que demuestra que los análisis de orina producen resultados falsos negativos con el doble de frecuencia que los análisis de hisopo bucal.
Una diferencia clave entre los dos tipos de pruebas consiste en detectar el THC, el químico activo en la marihuana. Forensic Fluids Laboratories informa que los hisopos bucales son capaces de detectar el uso hasta 72 horas después de que se usó el medicamento. Por el contrario, las pruebas de orina a menudo detectan THC en muestras hasta 120 horas después de usar el medicamento. MedicalHealthTests.com agrega que la eficacia de las pruebas puede variar ampliamente, ya que no existe una certificación o protocolos consistentes para guiar el proceso de prueba.
MedicalHealthTests.com explica que el cepillado, el uso de hilo dental y la práctica de la higiene bucal pueden hacer que el hisopo bucal genere un falso negativo. Un estudio de 2006, publicado en Clinical Biochemist Reviews, encontró que ingerir alcohol inmediatamente después de ingerir marihuana enjuaga temporalmente la boca y produce falsos negativos. Los autores del estudio sugieren que el agua puede tener un efecto similar. Los autores indican que las pruebas de 15 a 20 minutos después de dicho enjuague producen resultados más precisos.