El canal central, así como todo el sistema ventricular del que forma parte, está recubierto con ependima, una forma especializada de epitelio con células neurológicas. El canal central o el canal ependimario corre longitudinalmente a lo largo de la médula espinal y contiene líquido cefalorraquídeo.
El epitelio es un tejido especializado que recubre el interior de las superficies y cavidades del cuerpo y no contiene vasos sanguíneos. El ependima está formado por células ependyma, que producen líquido cefalorraquídeo en el plexo coroideo pero no en el canal central. Las células ependyma son cilíndricas simples cilíndricas. Los cilios que recubren las superficies de las células ependimales circulan el líquido cefalorraquídeo por todo el canal central y el sistema nervioso central. Los microvilos también cubren sus superficies y absorben el líquido cefalorraquídeo.
La liberación de líquido a través del ependima se controla mediante uniones estrechas y modificadas entre las células ependimales. Esta liberación de líquido permite el intercambio de líquido cefalorraquídeo entre el sistema ventricular y los tejidos neurológicos del cerebro y la médula espinal. La membrana basal de las células ependyma tiene extensiones similares a tentáculos que se adhieren a los astrocitos, una forma de célula neurológica. El líquido cefalorraquídeo protege y amortigua el cerebro y la médula espinal y ayuda a mantener el flujo sanguíneo neurológico adecuado. Es un 99 por ciento de agua y contiene proteínas plasmáticas.