El empalme de genes es una técnica utilizada en la ingeniería genética donde se edita el ADN de un ser vivo, en algunos casos reemplazando los genes existentes con genes tomados de otra planta o animal. Las enzimas se utilizan para cortar Cadena de ADN y remueve una pieza, que luego puede ser reemplazada con nueva información. Esto puede transferir características de una especie a otra o dar a un organismo características completamente nuevas.
Un ejemplo famoso de empalme de genes fue la implantación de un gen anticongelante en los tomates, creando una fruta resistente a las heladas. Dado que el gen anticongelante originalmente provenía de un pez adaptado para prosperar en aguas frías, los opositores de la modificación genética comenzaron a calificar el resultado de "tomate de pescado", a pesar del hecho de que no se transfirieron las características de los peces a la planta. Otro ejemplo es la transferencia de genes bioluminiscentes a varios organismos para ayudarlos a estudiar sus procesos de vida en el laboratorio.
En algunos casos, se crean genes completamente nuevos para ser empalmados en el ADN del organismo. La firma de biotecnología LS9 creó un lote completamente sintético de genes para plantar en una bacteria que consume azúcar, causando que el microorganismo excrete un compuesto funcionalmente idéntico al combustible diesel. Otras bacterias se han alterado para producir medicamentos que salvan vidas, y otro proyecto rediseñó la bacteria responsable de la caries dental para detener su producción de ácido láctico, eliminando su capacidad de dañar el esmalte dental.