La clonación crea controversia por varias razones, categorizadas en términos generales como preocupación por la seguridad humana y preocupación por el tratamiento animal inadecuado o no ético. La clonación atrae la resistencia de algunos para alterar los procesos biológicos para mejorar o crear ciertas características, como un color más brillante, un tamaño más grande o un pelaje más suave. Algunos argumentan que estos cambios entran en conflicto con las normas biológicas y plantean riesgos de enfermedad y enfermedad para los seres humanos y otros animales expuestos a los organismos genéticamente alterados.
La clonación atrae críticas en el contexto de la replicación de animales y plantas, e invita incluso a más críticas cuando se aplica a los humanos. Mientras que algunos investigadores y científicos elogian la clonación para erradicar ciertas enfermedades y facilitar la inmunización, otros citan la resistencia a las enfermedades y el desarrollo de nuevas alergias como contrapuntos. Algunos investigadores, por ejemplo, creen que beber leche de animales clonados, fortificados con nutrientes y antibióticos, podría controlar la propagación de enfermedades en áreas empobrecidas, resultando más efectivas y menos costosas que las vacunas tradicionales.
Otros, como los defensores del bienestar animal, advierten que esos movimientos son experimentales y no se basan en años de estudios científicos, lo que plantea cuestiones de seguridad. La clonación tiene críticas entre algunos biólogos sobre las preocupaciones de que la selección y el reemplazo de genes artificiales en última instancia cambia algunas especies, lo que las pone en riesgo de mutaciones, defectos e incluso extinciones, a medida que la variación genética disminuye con el tiempo.
