La pérdida de biodiversidad en ambientes marinos se atribuye a muchas fuentes, incluidas las actividades humanas como la caza y la pesca comercial, la adición de toxinas y sustancias químicas a las aguas circundantes y la pérdida o degradación de los hábitats costeros. Muchos factores contribuyen a la pérdida de la biodiversidad marina, pero las actividades humanas se encuentran entre los peores delincuentes. La pesca comercial, por ejemplo, elimina organismos clave del medio ambiente, lo que altera la cadena alimentaria y priva a otros organismos de sus fuentes tradicionales de alimentos.
La pérdida de biodiversidad se atribuye a eventos a corto y largo plazo. Los derrames de petróleo, las tormentas y la pesca son ejemplos de amenazas inmediatas que enfrentan los ambientes marinos. Otros factores adicionales son las toxinas y los productos químicos que se acumulan en los arroyos y vías fluviales y el crecimiento de las zonas urbanas y los centros urbanos, que reemplazan los humedales y los hábitats costeros con estructuras artificiales.
Muchas especies marinas pasan la vida recorriendo grandes distancias y reproduciéndose utilizando métodos de amplia difusión, como la dispersión de huevos en fuertes corrientes oceánicas. Las rutas de dispersión pueden ser interrumpidas por condiciones ambientales adversas y otros factores, que en última instancia ponen en peligro la supervivencia de las especies dependientes de la dispersión. La contaminación de nutrientes y químicos también es una causa de pérdida de biodiversidad. Solo las especies más resistentes pueden adaptarse a las condiciones alteradas causadas por la adición de toxinas y productos químicos en sus ecosistemas, que elimina a los organismos más débiles y vulnerables.
