Algunos de los microorganismos más dañinos para la humanidad son Staphylococcus aureus, Escheria coli, Enterococcus faecium y Pseudomonas aeruginosa. Los microorganismos que causan enfermedades se conocen como patógenos.
Todas las bacterias, la mayoría de los protozoos y algunos hongos son microorganismos. El término "microorganismos" se usa para indicar una forma de vida que no es visible para el ojo humano sin la ayuda de un microscopio. Estos pueden ser una sola célula o compuestos de muchas células. Hay microorganismos en cada tipo de ambiente en la Tierra, pero hay más microorganismos beneficiosos que los dañinos. La ingeniería genética implica la manipulación de microorganismos para crear características específicas en organismos más grandes.