La Sociedad Americana de Microbiología aún no ha encontrado una bacteria que cause enfermedades o que sea dañina para el cuerpo humano. Aunque estos microorganismos tienen muchas características de otras bacterias causantes de enfermedades, su conocimiento limitado.
Los metanógenos son una cepa de archae que se ha encontrado en el cuerpo humano. Hay preguntas sobre si son dañinas o beneficiosas. La dificultad de aislar y cultivar estas bacterias es parte de la razón por la que tan poco se puede probar al respecto. Se sabe que solo sobrevivirán y crecerán en un ambiente anaeróbico. Se encuentran entre las formas de vida más abundantes del planeta.
