Felix Dujardin hizo su mayor contribución a la teoría celular cuando propuso la clasificación de un nuevo tipo de organismo unicelular al que llamó rizopoda. La rizopoda de Felix Dujadin ahora se conoce como protozoos. >
Felix Dujardin también es conocido por su trabajo en refutar la teoría de Christian Gottfried Ehrenburg de que los organismos microscópicos tenían órganos con funciones similares a los órganos de los vertebrados. Al estudiar foraminíferos, Félix Dujardin también descubrió una estructura de vida sin forma que llamó sarcode, pero que hoy conocemos como protoplasma. También es conocido por su amplia investigación en grupos de invertebrados, como equinodermos, cnidarios y helmintos.