Las proteínas desnaturalizadas se hidrolizan y los enlaces peptídicos se descomponen en aminoácidos fácilmente digeribles. Los suplementos de proteínas a menudo contienen proteínas desnaturalizadas para aumentar la absorción. Los atletas usan proteínas desnaturalizadas para obtener proteínas suplementarias en sus músculos más rápidamente.
El proceso de desnaturalización no es lo suficientemente fuerte como para romper los enlaces peptídicos que forman los aminoácidos en las proteínas, por lo que siguen siendo útiles para los suplementos y las bebidas nutricionales. El calor es el principal método para desnaturalizar proteínas. La energía cinética del aumento de la temperatura hace que las moléculas de la proteína vibren y los enlaces se rompan. Algunas de las vitaminas y minerales se pierden durante el proceso, pero los aminoácidos generalmente permanecen intactos. Las proteínas desnaturalizadas en los polvos a menudo incluyen suplementos agregados para compensar los nutrientes perdidos.
La mayoría de las proteínas se desnaturalizan cuando las personas las comen. Cocinar las claras de huevo desnaturaliza la proteína. La desnaturalización reorganiza las proteínas, pero no las destruye. Algunas proteínas desnaturalizadas a altas temperaturas son inferiores en valor nutricional. La proteína desnaturalizante requiere ajustes precisos de la temperatura y, a menudo, un proceso que renaturaliza la proteína antes de usarla en polvos y suplementos. Los suplementos de proteínas sin desnaturalizar renuncian al proceso de desnaturalización y contienen más nutrientes originales. Los suplementos de proteínas se desnaturalizan principalmente para aumentar la absorción y reducir los contaminantes.