Hay tres grupos principales de Archaeabacteria: Crenarchaeota, Euryarchaeota y Korarchaeota. Crenarchaeota es extremadamente tolerante al calor, y Euryarchaeota sobrevive en hábitats sin oxígeno o salados. Los Korarchaeota son los menos entendidos de los grupos.
La mayoría de las Archaeabacterias son extremófilas que prosperan en hábitats que son inhóspitos para la mayoría de las demás vidas. Crenarchaeota son termófilos, muchos de los cuales también soportan azufre y alta acidez. Estos organismos viven en hábitats volcánicos y aguas termales. El pH de su entorno varía de 5 a 1, y resisten temperaturas de más de 230 grados Fahrenheit.
Euryarchaeota contiene halófilos, organismos que prosperan en entornos como los lagos de sal. Este grupo también incluye metanógenos que viven en condiciones anaeróbicas, como humedales e incluso los intestinos de otros animales. El gas metano es el producto del metabolismo del metanógeno.
Al igual que Crenarchaeota, Korarchaeota vive en hábitats de alta temperatura, como aguas termales. Estos organismos son primitivos, y son algunas de las Archaeabacterias menos comunes en la naturaleza.
Archaebacteria y Eubacteria, o bacterias verdaderas, comparten un ancestro común, y Archaeabacteria son similares a las bacterias verdaderas, así como a la vida eucariótica. La investigación sugiere que los eurkaryotes surgen, evolutivamente, de Archaeabacteria. Además, se plantea la hipótesis de que los eucariotas y la Crenarchaeota tienen más en común que los diferentes grupos de Archaeabacteria entre sí.
